一、HLA背景介绍
HLA(Human Leukocyte Antigen,人类白细胞抗原)是人类的主要组织相容性复合体(Major Histocompatibility Complex, MHC)表达的产物,其编码的分子参与抗原递呈,制约细胞间相互识别及诱导免疫应答。
HLA位于人类6号染色体短臂一段约3.6M的参与免疫反应的多态性区域,HLA复合体可以分为三个主要的区域,即经典HLA I类(HLA-A, B, C)、经典HLA II类(HLA-DP, DQ, DR)以及非经典HLA类。HLA分子的多样性非常高,即存在大量的等位基因变异,这种多态性保证了人类种群对各种病原体的广泛适应性和抵抗力。
二、HLA分型与T细胞受体(TCR)
TCR是T细胞表面的分子,能够识别并结合特定的抗原肽-MHC复合物。HLA负责呈递抗原肽给T细胞(HLA-多肽-TCR)。
在研究TCR时,同时进行HLA测序可以提供更全面的免疫反应信息:
1. 抗原特异性:通过分析TCR和HLA的结合模式,可以更好地理解T细胞如何识别特定的抗原。
2. 免疫反应的多样性:HLA基因具有高度的多态性,这意味着不同的个体可能对同一抗原有不同的反应。通过测序HLA基因,可以了解个体的免疫反应多样性。
3. 疾病关联:某些HLA等位基因参与甚至导致自身免疫性疾病、过敏性疾病、感染类疾病、代谢性疾病等几乎所有复杂疾病的发生、发展。研究HLA基因可以帮助识别疾病风险和开发个性化治疗。例如,银屑病与HLA-C*06:02,1型糖尿病与HLA-DQ2和HLA-DQ8,强直性脊柱炎和HLA-B27,类风湿关节炎与HLA-DR4,系统性红斑狼疮与HLA-DR3。
4. 疫苗设计:了解TCR和HLA的相互作用对于设计有效的疫苗至关重要,因为疫苗需要能够激活特定的T细胞反应。
5. 移植医学:在器官移植和骨髓移植中,HLA的I类和II类分子在异体移植排斥反应的过程中被认为是最易产生免疫性的抗原,捐赠者和接受者相匹配尤为重要。通过HLA测序,可以提高移植的成功率。
三、HLA多态性检测方法
传统的HLA分型技术包括血清学方法(如抗原结合能力检测法,ABC),以及基于PCR(聚合酶链式反应)的方法,如序列特异性引物(SSP)或序列特异性寡核苷酸探针(SSOP)。
1. 随着NGS技术的发展,HLA二代测序已经成为更高效、更准确的分型方法,可获得小至单个SNV 基因型的多态性,大至单体型信息。
2. 对于单位点HLA分型上,基于Sanger测序的SBT由于可以进行特定区域的精确测序,仍然有独特的优势,能兼顾准确快速和经济。
本公司的HLA-Seq平台能根据不同客户需求,灵活多样选择一代或二代测序进行HLA分型。
四、HLA-Seq 技术流程、检测范围
1. 方法流程
2. 检测范围:
四、HLA-Seq技术优势
1. 分辨率高:分型精度一般为4位,可高达8位精度分型。
2. 准确性高:NGS技术能够减少传统分型方法中可能出现的错误,提供更准确的HLA基因型数据。
3. 全面覆盖:覆盖HLA基因的全长,包括高变区,这有助于识别以前未发现的等位基因。
3. 高度灵活:可以针对不同的研究需求和样本类型进行定制。
五、送样建议
六、周期
10-21个工作日