艾沐蒽TCR测序助力探索移植后CMV再激活中的T细胞作用机制

巨细胞病毒(CMV)再激活是同种异体造血干细胞移植(allo-HSCT)后的一个重要问题,影响患者的治疗和预后。2024年9月30日浙江大学医学院附属第一医院传染病诊治国家重点实验室专家团队于Virology Journal杂志发表题为“Insights into cytomegalovirus-associated T cell receptors in recipients following allogeneic hematopoietic stem cell transplantation”的文章,该研究采用艾沐蒽的ImmuHub®TCR测序分析平台探索与移植后CMV再激活相关的TCR库特征,有助于CMV再激活的诊断和治疗。

研究结果

对移植后1个月时7例CMV再激活受者(CRR)和7例CMV未激活受者(CNR)的TCRβ库进行比较分析。结果如下:

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与CRR相比,CNR中独特CDR3基因序列和氨基酸序列的数量均显著更高(图1A-B)。

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使用Baroni-Urbani and Buser(BUB)指数评估两组的克隆重叠程度(图2),旨在确定CRR和CNR的T细胞库是否存在相似或不同,这可以深入了解它们免疫反应的共同性或独特性。CNR 组克隆重叠率显著高于CRR组,说明对CMV再激活有抵抗力的个体具有较高的CDR3同源性。


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然后作者分析了V、J基因使用情况,旨在确定与CRR或CNR相关的基因片段。TRBV6、TRBV23和TRBV7-8在CRR中的表达水平高于CNR(图3),这表明一些V基因与CMV结果相关,并且可能成为早期识别CMV再激活风险的生物标志物。

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图4显示了两组之间V-J基因组合的使用频率差异。与之前的研究相一致,与CRR相比,三种VJ组合(TRBV29-1/BJ1-2、TRBV2/BJ2-2 和 TRBV12-4/BJ1-5)在CNR中高度表达。另外该研究还新发现CNR中的TRBV14/BJ2-2和TRBV5-4/BJ1-4表达水平比CRR组更高。作者进一步研究以上5个VJ组合的基因序列,发现 CNRs的多样性高于CRRs。以上结果表明这些VJ基因组合可能在防止CMV感染和再激活方面发挥重要作用。

研究结论

该研究比较了allo-HSCT后早期具有不同CMV结局的受者之间的TCR序列,发现受者移植后TCR库的早期特征与CMV结果相关,可作为进一步研究的基础。该研究增强了对T细胞在CMV再激活中作用机制的理解。

文献来源:Xia J, Xiao Y, Gui G, Gong S, Wang H, Li X, Yan R, Fan J. Insights into cytomegalovirus-associated T cell receptors in recipients following allogeneic hematopoietic stem cell transplantation. Virol J. 2024 Sep 30;21(1):236. doi: 10.1186/s12985-024-02511-x.