发表于Journal of Allergy and Clinical Immunology杂志的一篇文章证明了严重联合免疫缺陷（SCID）患者移植后的TCR β库的多样性差则预示着免疫重建失败，可能需要二次干预。
发表时间：2022年3月
影响因子：14.2
研究方法：有31名接受造血细胞移植（HCT）（n=28）或基因治疗（GT）（n=3）作为一线最终治疗的SCID儿童纳入研究。分别在HCT之前和HCT后3个月、6个月、12个月及每年治疗后采集外周血样本，最长达4年，提取RNA，使用5`RACE+UMI（独特分子条形码）技术进行TCR β链二代测序。
图1
通过Shannon[H]和Simpson[1-D]指数测量观察到在细胞治疗后3个月时库多样性严重受限，在6个月时显著改善，多样性增加（P<0.01）（图1A-C）.
在所有接受HCT的患者中，3个月时Shannon[H]指数≤5.2的患者被认为需要进行第二次干预（异体HCT或GT)，当需要第二次干预时，HCT被认为是不成功的。与不成功的HCT相比，成功HCT后的多样性改善更快（图1D）。
图1
在治疗后6个月，H指数与初始CD4+T细胞总数显著相关（Rs = 0.89；P=0.001）（图1E），T细胞是预测免疫重建质量的生物标志物。
图1F反映了基因型与HCT后免疫重建的关系。12名存在IL2RG、IL7R和JAK3基因缺陷的患者与11名存在RAG和DCLRE1C基因缺陷的患者相比，TCR多样性的发展动力学相似（RAG/DCLRE1C组在3个月的时间点仅有1个样本，不足以评估两组之间的差异是否显著）。
图2
在RAG/DCLRE1C组中，无预处理或免疫抑制（immune suppression）的HCT的多样性持续低于清髓性（MAC）或低强度（RIC）预处理的HCT（P <0.01）（图2A）；而在IL2RG/IL7R/JAK3组中，接受HCT免疫抑制的12名患者均达到正常的多样性（图2B）。
从HCT后12个月开始，来自匹配供体的HCT比来自不匹配供体的HCT具有更高的TCR多样性（P=0.01）（图2C）。
图3
HCT后6个月的CD4+T细胞计数超过500个/mm3或初始CD4+T细胞计数超过200个/mm3与HCT后24和36个月更高的TRB多样性相关（P <0.01）（图3A、B），说明HCT术后6个月的CD4+T细胞计数可预测持续的免疫重建。
与7例健康儿童相比，所有27例SCID患者在HCT后3个月的TRB序列富含CDR3顶端含有半胱氨酸残基的独特reads——这是一种自我反应性的生物标志物（图3C）。在SCID治疗后的早期T细胞库中，这种分子特征的出现可能有助于解释在这些患者中发生自身免疫性疾病的风险更高。
HSCT患者Immun-Cheq®检测报告图示
（2）样本要求：
5ml左右血液样本（EDTA抗凝管）， 4°C 运输，24-48h内送达。
（3）检测周期：
收到样本后，15个工作日内出具结果报告。
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杭州艾沐蒽生物科技有限公司成立于2016年，是国内前沿的专注于免疫基因组学技术的国家高新技术企业。创始人团队来自美国芝加哥大学，在2010年开始使用免疫组高通量测序技术开展各种疾病相关研究，于2016年通过自主研发，全国首家推出NGS-MRD血液肿瘤微小残留病（MRD）检测Seq-MRD®，并授权泛生子（纳斯达克代码：GTH）使用。同时，公司拥有Immun-Traq®肿瘤治疗伴随诊断、Immun-Cheq® |T细胞免疫测评以及ImmuHub®免疫组测序科研服务产品，并布局有基于AI机器学习算法的T-classifier®疾病早筛、单细胞测序、TCR-T药物开发等平台管线。公司构建几十项发明专利和软件著作权为核心的自主知识产权体系，为医院临床、生命科学研究、新药开发等提供解决方案和产品。
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