ImmuHub®
T 细胞属于人体免疫细胞，它在肿瘤免疫治疗，自身免疫疾病以及移植耐受等方面发挥着重要的作用。每个 T 细胞都有自己特殊的 T 细胞受体 (TcR)，就像每一个细胞的身份证。对TcR测序分析可以准确监测我们免疫系统对疾病和治疗的反应，可以帮助科研者了解疾病与免疫系统的相互作用。
TcR 作用是识别抗原。T 细胞通过细胞表面的 TcR 来识别抗原呈递细胞带来的抗原，每一个 T 细胞含有一个特异的 TcR 用来识别相对特异的抗原。T 细胞通过 TcR 基因的重组从而达到其多样化 (Diversity) 的特点（如下图），并可识别各种抗原与之反应。
T 细胞受体是由α链和β链组成的（如图）。TcR 转录子是通过基因组里的α链或β链上的 V,(D),J 基因随机排序出来的。抗原主要结合的区域叫 CDR3 (Complementarity Determining Region 3)，TcR 会经常出现核苷酸随机重组，所以每个人的 T 细胞受体就会有很高的多样性，这样就造成了 T 细胞受体的种类理论上会高达 1018 种。所以对健康的人和病人的 T 细胞受体测序是做好预防医学和个性化治疗的基础。
ImmuHub®的技术优势
更少实验误差，更全面准确的分析
• 基于 RNA 的分析检测，这样除去了内含子，避免了不必要的引物及消耗和结果误差，获得的数据是基于表达的（有功能的）T、B细胞受体；
• 单对引物（5‘RACE）方法文库构建准确率高，测序数据与IMGT ® 数据库基因座匹配正确率可达97%-99.7%，并能扩增TCR和BCR的V-(D)-J 序列全长(包括 FR1-4 和 CDR1-3)；
• 深度测序并使用世界领先生物信息学分析算法对数据进行处理，可进行下机数据全自动生信分析(无人值守)及纠错，纠正PCR和测序引入的错误，有更强的纠错能力和错配处理能力，更大程度的获得有效数据，挖掘测序获得的有效信息；
• 自主研发PCR反应体系稳定，接头序列连接效率高、目标基因扩增效率高；扩增灵敏度极高，RNA模板量最小化，最低可达10ng，为小或珍惜临床样本（如肿瘤病人骨髓或穿刺样本）获得测序可能性；
• BCR文库构建使用的优化引物可有效鉴别更多IGH链亚型，如IgA1, IgA2，IgG1, IgG2, IgG3, IgG4，IgE，IgM等；
• 相对多重PCR技术，可以完全避免引物偏好性。
提取样本 RNA
我们将从客户送来的样本里提取客户所需要的T细胞亚型的 RNA，RNA 质量监控在样本备置中有着非常重要的作用，我们的每一步都会通过先进的设备，如 TapeStation (Agilent Technologies, Inc.)，对 RNA 和 cDNA 进行质量监控。如果样本质量不好，我们不会进行下一步，我们会联系客户或者使用其他方法获得更好质量的样本。
cDNA 合成和文库构建
我们将从客户送来的样本里提取客户所需要的T细胞亚型的 RNA，RNA 质量监控在样本备置中有着非常重要的作用，我们的每一步都会通过先进的设备，如 TapeStation (Agilent Technologies, Inc.)，对 RNA 和 cDNA 进行质量监控。如果样本质量不好，我们不会进行下一步，我们会联系客户或者使用其他方法获得更好质量的样本。
基于UMB的超强纠错
在原始RNA模板扩增前加入UMB（Unique Molecular Barcode，独立分子条形码）进行文库构建，可对后续PCR反应或测序过程中的错误进行有效纠正，还原真实的数据，完全杜绝PCR错误和测序错误，从而提高准确率。 模拟无PCR化测序，还原PCR之前的真实分子数量。
高通量测序
我们可使用 NextSeq® (Illumina Inc.) 2 × 300 bp pair-end 方法来对 TcR 进行测序，保证 TcR 的全长序列都可获得。亦可使用NovaSeq® 以获得更大的通量和更便宜的价格。
数据分析
TcR 的测序数据将通过我们世界领先的生物信息学分析算法进行处理
ImmuHub®的测序服务步骤
服务流程:客户提供样本，通常为全血、骨髓、单个核细胞、分离后的T细胞、RNA/cDNA或者石蜡包埋的组织[FFPE]，送达公司实验室后，实验室根据样本的情况，进行血液或骨髓的T细胞分离→ RNA 提取→ cDNA 合成→测序文库构建→第二代基因测序→生物信息学处理→数据分析和出图→临床信息分析（如下图）。 45个工作日后客户获得测序结果报告。
标准分析（免费）
1.CDR3克隆鉴定、计数、频率
2.克隆性指数和多样性指数
3.CDR3核酸序列长度
4.气泡图
5.V/D/J基因频率分布柱状图
6.V/D/J/基因频率分布饼状图
7.V-J基因片段组合circos图
8.V-J基因片段组合使用森林图
9.V-J基因片段组合使用热力图
10.克隆频率分类呈现蜗牛图
11.全长克隆序列分析
深度分析（收费）
1. V-J基因片段组合
（1）V-J基因组合频率差异分析
（2）显著性差异V-J基因组合箱线图
2. V/D/J基因片段使用频率
（1）V/D/J基因使用频率heatmap图
（2）V/J基因使用频率丰度差异分析
（3）显著性差异V/J基因的使用频率箱线图
（4）V/J克隆频率Tree-map图
3. 两个（或多个）样本共享克隆统计分级
（1）共享克隆和独有克隆的频率点状图
（2）共享克隆频率追踪图
（3）多样本间独有及共享克隆分布文氏图和多维venn图
4.Top克隆在多个样本中的追踪分析
（1）热力学追踪图
（2）多样本间的克隆追踪堆积图
5. 两个或多个样本、组间的克隆性变化、多样性指数比较
6.比较多组样本中每组样本相似度计算——统计各样本间的MOI值
7.样本间V-J使用情况主成分分析（PCA）
8.不同样本的Top N克隆分类频率分布图
9. 多个样本CDR3 Motif、Gliph分析
10. 各样本间CDR3序列Logo图
11. 多样本间的CDR3基因的Cytocape分析。
12.Top100克隆Levenshtein聚类图
13.CDR3 AA序列的理化特性的聚类分析
14. BCR特有分析
（1）B细胞同型转换频率组间箱线图
（2）体细胞超突变频率散点图
（3）抗体序列系统发育树分析
其他个性化分析依据需求难度收费
由客户明确提供需要的具体分析和图示以及附上参考文献。
【1.】 T细胞受体基因的专业术语起初是两个字母——“TR”，由国际人类基因命名委员会（HGNC）1999年审核通过。因而当提及到基因、基因座和链时，TR应该是最准确的描述。不过TcR是目前用得最广泛的。但是，大写的 ”TCR“ 缩写混淆了基因命名，应该避免。