你还不快跟上?全球人类免疫组计划即将启动!

Human Immunome Project

人类免疫组计划

据《科学》杂志报道,2024年人类免疫组计划(Human Immunome Project,HIP)正式启动。HIP计划得到了一个由公司、政府机构和大学组成的国际联盟的支持,该计划将探测血液和组织样本中的数千种免疫变量。结果可能是世界上最大和最全面的免疫学数据库,这是科学家研究免疫系统差异以及它们如何影响我们对疫苗和药物的反应。

在心脏病学领域,脂质检测可以揭示病人的心血管健康状况和疾病风险。然而,免疫学并没有一套类似的简单测量方法表明一个人的免疫系统状态。HIP的目标就是提出一个统一的测量方法,像脂质检测一样,提供免疫系统功能的读数。

HIP是之前人类疫苗项目的一个分支,HIP还会将得到的数据用作新的人工智能(AI)模型素材数据作为新的人工智能(AI)模型的素材,这些模型可以预测整个人群的免疫系统反应,不仅为制药公司和政府,甚至为医生和患者提供有价值的见解。

背景

人类免疫系统是一个动态的、多尺度的网络,涉及分子、细胞和器官之间独特复杂的相互作用。它监测、反应并保护身体免受入侵的病原体和其他压力源的侵害,因此在维持人类健康方面发挥着关键作用。尽管应用多组学方法和免疫监测技术取得了巨大进步,但数据的大小和范围仍然有限。因此,了解全球范围内免疫多样性所需的免疫学数据不到百分之一是可用的。研究团队计划在接下来的五年中,人类免疫组项目的重点是生成多组学免疫学基线数据,这些数据反映了不同年龄、地理位置、健康状况、性别和社会经济地位的不同人群,数据生成将分阶段进行。

HIP实施计划
第一阶段

1. 在先锋站点收集数据

   研究团队计划先在非洲、澳大利亚、东亚、欧洲、中东、北美和南美建立七个最先进的收集站,该项目在每个地点将研究大约500人,测量免疫变量,包括不同类型免疫细胞的丰度、基因活性、代谢分子的浓度和DNA序列,从大量的数据中,该项目将选择几个变量,提供免疫系统如何工作的最清晰的画面。

2. 制定 HIP 场地规划以进行扩展

       通过与先锋站点的密切合作,并借鉴他们的经验,团队将完善协议和站点结构,建立一个可复制的站点模型,该模型可以扩展到全球 70-100 个站点,包括在有限的资源和基础设施。这一过程将包括完善并在需要时进一步开发所需的检测方法,确保标准化的质量,并在我们扩大数据收集规模时优先捕获最重要的免疫参数。

3. 工程化免疫监测试剂盒(IMK)

为了克服可复制性、财务和通用部署挑战,我们正在开发和设计我们自己的免疫监测试剂盒,这将使我们能够大规模地从不同人群中捕获标准化和多组学数据。该试剂盒将重点关注优先化的检测子集,从而简化数据收集并限制成本,该子集将捕获大部分(>80%)所需信息并确保可重复的结果。

IMK 的最终工程将与先锋站点密切合作完成,先锋站点将使用其数据为 IMK 的开发提供信息,包括在测试和评估以及工程和改进之间进行迭代。完成后,它将重点关注三种数据类型:(1)主要免疫细胞频率的测量;(2) 蛋白质和转录物子集的单细胞测量;(3) 染色质可及性的单细胞测量。

第二阶段

1. 在全球建立70-100个数据采集点

      研究团队计划扩大到遍布全球的 70-100 个研究点,从每个研究点500个增加到大约 10,000 个,该项目全球研究方案和规模参与者人数旨在捕捉个体的多样性,从而获得免疫功能和反应。这种优先排序对于确保我们的数据集反映年龄、种族、健康状况、性别和社会经济地位的免疫差异至关重要。

2. 部署免疫监测试剂盒

      免疫监测试剂盒是 HIP 科学方法的核心,因为它不仅确保测量的一致性,而且使当地站点能够开发数据生成、处理和存储能力。

人类免疫组计划不仅打算建立预测模型,还打算建立能够复制免疫系统运作方式的模型。HIP最终计划获得近2万亿个免疫测量数据,并公开提供给研究者,这些数据也将被用于构建免疫系统的人工智能模型,从而加速医学研究、药物开发、改善人群健康并减少医疗成本。

艾沐蒽专注于免疫诊断发展方向,致力于将TCR和BCR测序技术应用于癌症、自身免疫性疾病、传染性疾病等免疫介导性疾病的诊断和治疗中。ImmuHub®是艾沐蒽自主研发的一套灵活度极高的TCR和BCR二代测序平台,利用5’RACE或多重PCR技术,使我们能直接从基因组RNA或DNA来扩增TCR/BCR的全长序列或CDR3区序列,从而进行高通量测序和数据分析。

     ImmuHub®提供了真正捕获免疫系统所需的深度和广度,TCR/BCR作为T/B细胞克隆的一个独特性标记,能够随着时间的变化来跟踪T细胞和B细胞,表征免疫系统的多样性,并评估反映疾病和治疗的动态情况,如免疫组测序提供的一个有价值的指标是克隆性,这是一种检测受体序列在群体中分布均匀程度的方法,可以量化免疫系统对一组特定抗原的集中程度。

关于艾沐蒽

杭州艾沐蒽生物科技有限公司成立于2016年,是国际前沿的专注于免疫驱动医学技术的国家高新技术企业。创始人团队来自美国芝加哥大学,在2010年开始使用免疫组基因高通量测序技术开展各种疾病相关研究,于2016年通过自主研发,全国首家推出NGS-MRD血液肿瘤微小残留病(MRD)检测Seq-MRD®,并授权泛生子(纳斯达克代码:GTH)使用。同时,公司拥有Immun-Traq®肿瘤治疗伴随诊断、Immun-Cheq® |T细胞免疫测评以及ImmuHub®免疫组测序科研服务产品,并布局有基于AI机器学习算法的T-classifier®肿瘤早筛、单细胞测序、TCR-T和抗体发现等平台管线。目前为止发表了数十篇论文,其中包括:Nature(IF:65), Signal Transduction and Targeted Therapy(IF:40), Cellular and Molecular Immunology(IF:24), Nature Communications (IF:17)等多篇高分杂志。公司构建几十项发明专利和软件著作权为核心的自主知识产权体系,为医院临床、生命科学研究、新药开发等提供解决方案和产品。艾沐蒽专注于通过解码适应性免疫系统来改变疾病的诊断和治疗,并致力于推进免疫驱动医学领域发展。

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